سین‌دخت انستیتیوت مستقل، غیر دولتی و پژوهشی‌ست. هدف ما ترویج تفکر انتقادی، تولید دانش پژوهشی-علمی با تمرکز به مطالعات زنان و مسایل حقوق بشری است. ما در راستای حمایت از متضررین، قربانیان متضررین و قربانیان جنگ و گروه‌های آسیب‌پذیرچون زنان، کودکان، دگرباشان و اقلیت‌های قومی حاشیه‌نشین فعالیت می‌نماییم. هدف نهایی ما ایجاد جامعه‌ی مبتنی بر اصول بنیادین حقوق بشری است که حقوق اساسی انسان‌ها رعایت و کلیه متضررین و بازماندگان متضررین و قربانیان جنگ بدون تبعیض و با رعایت کرامت انسانی از دسترسی مؤثر و برابر به حمایت‌های حقوقی، قانونی، امنیت و عدالت برخوردار باشند.ماموریت ما حمایت از کرامت انسانی و همدلی با افرادی است که از متضررین و قربانیان جنگ آسیب دیده‌اند. سین‌دخت با بهره‌گیری از تخصص، دانش و تجربیات پژوهشگران و دانش‌پژوهان در حوزه‌های مختلف علوم با راه اندازی گفت‌و‌گوهای علمی، چاپ و انتشار کتب‌ و مقالات تخصصی-علمی تلاش می‌کند تا ارزش‌های حقوق بشری را در افغان‌ستان نهادینه ساخته تا در شکل‌گیری جامعه‌ای عادل، برابر و التیام‌یافته از رنج و الام جنگ چندین ساله کمک نماید.